Visi Balai Kekarantinaan Kesehatan Kelas II Biak yakni Mewujudkan Pintu Masuk Negara dan Wilayah yang Bebas Penyakit dan Faktor Risiko.
Misi Balai Kekarantinaan Kesehatan Kelas II Biak yakni:
- Meningkatkan deteksi dini dan respon penyakit dan faktor risiko;
- Meningkatkan kualitas kesehatan lingkungan dan alat angkut di pintu masuk negara;
- Meningkatkan tata kelola kegiatan yang bersih dan akuntabel;
- Peningkatan Sumber Daya Manusia.
Sasaran Balai Kekarantinaan Kesehatan Kelas II Biak yaitu :
- Meningkatnya Pelayanan Kekarantinaan di pintu masuk negara dan wilayah
- Meningkatnya dukungan dan pelaksanaan tugas teknis lainnya